晶码战士第二部全集成功营救药老后，重伤的萧炎被带回星辰塔闭关，得益于三千焱炎火和星辰之力的修复，沉睡了一年的萧炎终于苏醒，并晋升为了斗尊。为了修复药老的本源魂气，萧炎决定前往远古时期斗圣留下的遗迹，然而，无数势力都窥觑此地的天阶斗技和斗圣骸骨，在遗迹未开启之前，已经有多方势力汇聚于此，所有人都想分一杯羹，与此同时，魂殿的威胁也迫在眉睫，萧炎唯有火中取栗，方可博得一线生机。